Protein–RNA interactions for Protein: A4FU01

MTMR11, Myotubularin-related protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR11A4FU01 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTMR11A4FU01 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTMR11A4FU01 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTMR11A4FU01 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTMR11A4FU01 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTMR11A4FU01 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTMR11A4FU01 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTMR11A4FU01 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTMR11A4FU01 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTMR11A4FU01 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTMR11A4FU01 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTMR11A4FU01 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTMR11A4FU01 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTMR11A4FU01 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTMR11A4FU01 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTMR11A4FU01 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MTMR11A4FU01 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTMR11A4FU01 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTMR11A4FU01 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTMR11A4FU01 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTMR11A4FU01 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTMR11A4FU01 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTMR11A4FU01 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTMR11A4FU01 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTMR11A4FU01 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTMR11A4FU01 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTMR11A4FU01 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTMR11A4FU01 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTMR11A4FU01 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTMR11A4FU01 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTMR11A4FU01 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTMR11A4FU01 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTMR11A4FU01 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTMR11A4FU01 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MTMR11A4FU01 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTMR11A4FU01 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTMR11A4FU01 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTMR11A4FU01 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTMR11A4FU01 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTMR11A4FU01 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTMR11A4FU01 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTMR11A4FU01 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTMR11A4FU01 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTMR11A4FU01 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTMR11A4FU01 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTMR11A4FU01 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTMR11A4FU01 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTMR11A4FU01 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MTMR11A4FU01 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTMR11A4FU01 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTMR11A4FU01 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTMR11A4FU01 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTMR11A4FU01 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTMR11A4FU01 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTMR11A4FU01 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTMR11A4FU01 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTMR11A4FU01 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTMR11A4FU01 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTMR11A4FU01 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTMR11A4FU01 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTMR11A4FU01 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTMR11A4FU01 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTMR11A4FU01 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTMR11A4FU01 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTMR11A4FU01 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTMR11A4FU01 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTMR11A4FU01 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTMR11A4FU01 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTMR11A4FU01 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTMR11A4FU01 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTMR11A4FU01 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTMR11A4FU01 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTMR11A4FU01 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTMR11A4FU01 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTMR11A4FU01 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTMR11A4FU01 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTMR11A4FU01 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTMR11A4FU01 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTMR11A4FU01 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTMR11A4FU01 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTMR11A4FU01 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTMR11A4FU01 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTMR11A4FU01 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTMR11A4FU01 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTMR11A4FU01 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTMR11A4FU01 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTMR11A4FU01 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MTMR11A4FU01 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MTMR11A4FU01 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MTMR11A4FU01 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTMR11A4FU01 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTMR11A4FU01 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTMR11A4FU01 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTMR11A4FU01 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTMR11A4FU01 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTMR11A4FU01 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTMR11A4FU01 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTMR11A4FU01 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTMR11A4FU01 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTMR11A4FU01 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms