Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ7

PRAMEF27, PRAME family member 27, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF27A3QJZ7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF27A3QJZ7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF27A3QJZ7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF27A3QJZ7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF27A3QJZ7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF27A3QJZ7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF27A3QJZ7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF27A3QJZ7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF27A3QJZ7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF27A3QJZ7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF27A3QJZ7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF27A3QJZ7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF27A3QJZ7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF27A3QJZ7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRAMEF27A3QJZ7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF27A3QJZ7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF27A3QJZ7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF27A3QJZ7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF27A3QJZ7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF27A3QJZ7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF27A3QJZ7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF27A3QJZ7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF27A3QJZ7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF27A3QJZ7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF27A3QJZ7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF27A3QJZ7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF27A3QJZ7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF27A3QJZ7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF27A3QJZ7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF27A3QJZ7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF27A3QJZ7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF27A3QJZ7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF27A3QJZ7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF27A3QJZ7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF27A3QJZ7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF27A3QJZ7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF27A3QJZ7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF27A3QJZ7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF27A3QJZ7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF27A3QJZ7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF27A3QJZ7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF27A3QJZ7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF27A3QJZ7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF27A3QJZ7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF27A3QJZ7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF27A3QJZ7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF27A3QJZ7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF27A3QJZ7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF27A3QJZ7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF27A3QJZ7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF27A3QJZ7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF27A3QJZ7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF27A3QJZ7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF27A3QJZ7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF27A3QJZ7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF27A3QJZ7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF27A3QJZ7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF27A3QJZ7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF27A3QJZ7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF27A3QJZ7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF27A3QJZ7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF27A3QJZ7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF27A3QJZ7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF27A3QJZ7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF27A3QJZ7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEF27A3QJZ7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEF27A3QJZ7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEF27A3QJZ7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEF27A3QJZ7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEF27A3QJZ7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEF27A3QJZ7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEF27A3QJZ7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEF27A3QJZ7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEF27A3QJZ7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEF27A3QJZ7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEF27A3QJZ7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEF27A3QJZ7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRAMEF27A3QJZ7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PRAMEF27A3QJZ7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRAMEF27A3QJZ7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PRAMEF27A3QJZ7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF27A3QJZ7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF27A3QJZ7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF27A3QJZ7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF27A3QJZ7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF27A3QJZ7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF27A3QJZ7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF27A3QJZ7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF27A3QJZ7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF27A3QJZ7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF27A3QJZ7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF27A3QJZ7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEF27A3QJZ7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEF27A3QJZ7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEF27A3QJZ7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEF27A3QJZ7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEF27A3QJZ7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEF27A3QJZ7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEF27A3QJZ7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEF27A3QJZ7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms