Protein–RNA interactions for Protein: A0PK11

CLRN2, Clarin-2, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLRN2A0PK11 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CLRN2A0PK11 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CLRN2A0PK11 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CLRN2A0PK11 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CLRN2A0PK11 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CLRN2A0PK11 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CLRN2A0PK11 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CLRN2A0PK11 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CLRN2A0PK11 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CLRN2A0PK11 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CLRN2A0PK11 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
CLRN2A0PK11 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CLRN2A0PK11 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CLRN2A0PK11 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CLRN2A0PK11 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CLRN2A0PK11 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CLRN2A0PK11 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CLRN2A0PK11 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CLRN2A0PK11 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CLRN2A0PK11 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CLRN2A0PK11 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CLRN2A0PK11 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CLRN2A0PK11 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CLRN2A0PK11 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CLRN2A0PK11 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CLRN2A0PK11 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CLRN2A0PK11 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CLRN2A0PK11 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CLRN2A0PK11 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLRN2A0PK11 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLRN2A0PK11 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLRN2A0PK11 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CLRN2A0PK11 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CLRN2A0PK11 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CLRN2A0PK11 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLRN2A0PK11 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLRN2A0PK11 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLRN2A0PK11 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLRN2A0PK11 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLRN2A0PK11 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLRN2A0PK11 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLRN2A0PK11 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLRN2A0PK11 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CLRN2A0PK11 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLRN2A0PK11 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLRN2A0PK11 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CLRN2A0PK11 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLRN2A0PK11 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLRN2A0PK11 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLRN2A0PK11 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLRN2A0PK11 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLRN2A0PK11 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLRN2A0PK11 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLRN2A0PK11 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLRN2A0PK11 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLRN2A0PK11 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLRN2A0PK11 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CLRN2A0PK11 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLRN2A0PK11 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLRN2A0PK11 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLRN2A0PK11 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CLRN2A0PK11 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLRN2A0PK11 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CLRN2A0PK11 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLRN2A0PK11 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLRN2A0PK11 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLRN2A0PK11 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CLRN2A0PK11 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CLRN2A0PK11 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CLRN2A0PK11 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CLRN2A0PK11 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CLRN2A0PK11 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CLRN2A0PK11 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CLRN2A0PK11 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CLRN2A0PK11 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CLRN2A0PK11 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLRN2A0PK11 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLRN2A0PK11 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLRN2A0PK11 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLRN2A0PK11 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLRN2A0PK11 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLRN2A0PK11 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLRN2A0PK11 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLRN2A0PK11 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLRN2A0PK11 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLRN2A0PK11 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLRN2A0PK11 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CLRN2A0PK11 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLRN2A0PK11 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CLRN2A0PK11 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLRN2A0PK11 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLRN2A0PK11 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLRN2A0PK11 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLRN2A0PK11 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLRN2A0PK11 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLRN2A0PK11 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLRN2A0PK11 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLRN2A0PK11 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLRN2A0PK11 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLRN2A0PK11 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms