Protein–RNA interactions for Protein: A0A0D9SFI3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0D9SFI3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
A0A0D9SFI3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
A0A0D9SFI3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
A0A0D9SFI3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
A0A0D9SFI3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
A0A0D9SFI3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
A0A0D9SFI3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
A0A0D9SFI3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
A0A0D9SFI3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
A0A0D9SFI3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
A0A0D9SFI3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
A0A0D9SFI3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
A0A0D9SFI3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
A0A0D9SFI3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
A0A0D9SFI3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
A0A0D9SFI3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
A0A0D9SFI3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
A0A0D9SFI3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
A0A0D9SFI3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
A0A0D9SFI3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
A0A0D9SFI3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
A0A0D9SFI3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
A0A0D9SFI3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
A0A0D9SFI3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
A0A0D9SFI3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
A0A0D9SFI3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
A0A0D9SFI3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
A0A0D9SFI3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
A0A0D9SFI3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
A0A0D9SFI3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
A0A0D9SFI3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
A0A0D9SFI3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
A0A0D9SFI3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
A0A0D9SFI3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
A0A0D9SFI3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
A0A0D9SFI3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
A0A0D9SFI3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
A0A0D9SFI3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
A0A0D9SFI3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
A0A0D9SFI3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
A0A0D9SFI3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
A0A0D9SFI3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
A0A0D9SFI3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
A0A0D9SFI3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
A0A0D9SFI3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
A0A0D9SFI3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
A0A0D9SFI3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
A0A0D9SFI3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
A0A0D9SFI3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
A0A0D9SFI3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
A0A0D9SFI3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
A0A0D9SFI3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
A0A0D9SFI3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
A0A0D9SFI3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
A0A0D9SFI3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
A0A0D9SFI3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
A0A0D9SFI3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
A0A0D9SFI3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
A0A0D9SFI3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
A0A0D9SFI3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
A0A0D9SFI3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
A0A0D9SFI3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
A0A0D9SFI3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
A0A0D9SFI3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
A0A0D9SFI3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
A0A0D9SFI3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
A0A0D9SFI3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
A0A0D9SFI3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
A0A0D9SFI3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
A0A0D9SFI3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
A0A0D9SFI3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
A0A0D9SFI3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
A0A0D9SFI3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
A0A0D9SFI3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
A0A0D9SFI3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
A0A0D9SFI3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
A0A0D9SFI3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
A0A0D9SFI3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
A0A0D9SFI3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
A0A0D9SFI3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
A0A0D9SFI3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
A0A0D9SFI3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
A0A0D9SFI3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
A0A0D9SFI3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
A0A0D9SFI3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
A0A0D9SFI3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
A0A0D9SFI3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
A0A0D9SFI3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
A0A0D9SFI3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
A0A0D9SFI3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
A0A0D9SFI3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
A0A0D9SFI3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
A0A0D9SFI3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
A0A0D9SFI3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
A0A0D9SFI3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
A0A0D9SFI3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
A0A0D9SFI3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
A0A0D9SFI3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
A0A0D9SFI3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
A0A0D9SFI3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms