Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F8

CDY1, Testis-specific chromodomain protein Y 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDY1Q9Y6F8 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDY1Q9Y6F8 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDY1Q9Y6F8 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDY1Q9Y6F8 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDY1Q9Y6F8 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDY1Q9Y6F8 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDY1Q9Y6F8 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDY1Q9Y6F8 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDY1Q9Y6F8 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDY1Q9Y6F8 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDY1Q9Y6F8 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDY1Q9Y6F8 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDY1Q9Y6F8 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDY1Q9Y6F8 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDY1Q9Y6F8 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDY1Q9Y6F8 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDY1Q9Y6F8 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDY1Q9Y6F8 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDY1Q9Y6F8 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDY1Q9Y6F8 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDY1Q9Y6F8 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDY1Q9Y6F8 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDY1Q9Y6F8 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDY1Q9Y6F8 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDY1Q9Y6F8 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDY1Q9Y6F8 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDY1Q9Y6F8 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDY1Q9Y6F8 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDY1Q9Y6F8 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDY1Q9Y6F8 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDY1Q9Y6F8 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDY1Q9Y6F8 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDY1Q9Y6F8 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDY1Q9Y6F8 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDY1Q9Y6F8 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDY1Q9Y6F8 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDY1Q9Y6F8 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDY1Q9Y6F8 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDY1Q9Y6F8 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDY1Q9Y6F8 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDY1Q9Y6F8 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDY1Q9Y6F8 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDY1Q9Y6F8 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDY1Q9Y6F8 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDY1Q9Y6F8 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDY1Q9Y6F8 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDY1Q9Y6F8 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDY1Q9Y6F8 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDY1Q9Y6F8 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDY1Q9Y6F8 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDY1Q9Y6F8 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDY1Q9Y6F8 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDY1Q9Y6F8 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDY1Q9Y6F8 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDY1Q9Y6F8 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDY1Q9Y6F8 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDY1Q9Y6F8 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDY1Q9Y6F8 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDY1Q9Y6F8 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDY1Q9Y6F8 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDY1Q9Y6F8 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDY1Q9Y6F8 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDY1Q9Y6F8 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDY1Q9Y6F8 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDY1Q9Y6F8 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDY1Q9Y6F8 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDY1Q9Y6F8 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDY1Q9Y6F8 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDY1Q9Y6F8 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDY1Q9Y6F8 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDY1Q9Y6F8 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDY1Q9Y6F8 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDY1Q9Y6F8 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDY1Q9Y6F8 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDY1Q9Y6F8 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDY1Q9Y6F8 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDY1Q9Y6F8 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDY1Q9Y6F8 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDY1Q9Y6F8 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDY1Q9Y6F8 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDY1Q9Y6F8 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDY1Q9Y6F8 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDY1Q9Y6F8 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDY1Q9Y6F8 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDY1Q9Y6F8 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDY1Q9Y6F8 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDY1Q9Y6F8 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDY1Q9Y6F8 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDY1Q9Y6F8 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDY1Q9Y6F8 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDY1Q9Y6F8 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDY1Q9Y6F8 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDY1Q9Y6F8 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDY1Q9Y6F8 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDY1Q9Y6F8 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDY1Q9Y6F8 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDY1Q9Y6F8 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDY1Q9Y6F8 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDY1Q9Y6F8 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDY1Q9Y6F8 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms