Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms