Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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