Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCDHA12Q9UN75 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms