Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC11.24□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms