Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158.5 ms