Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX09

DDIT4, DNA damage-inducible transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT4Q9NX09 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms