Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms