Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4E5

RHOJ, Rho-related GTP-binding protein RhoJ, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOJQ9H4E5 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms