Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY10

SLC46A2, Thymic stromal cotransporter homolog, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A2Q9BY10 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC46A2Q9BY10 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms