Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms