Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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PKP4Q99569 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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PKP4Q99569 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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PKP4Q99569 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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PKP4Q99569 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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PKP4Q99569 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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PKP4Q99569 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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PKP4Q99569 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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PKP4Q99569 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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