Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms