Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC11□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC11□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms