Protein–RNA interactions for Protein: Q96FM1

PGAP3, Post-GPI attachment to proteins factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAP3Q96FM1 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PGAP3Q96FM1 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGAP3Q96FM1 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGAP3Q96FM1 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGAP3Q96FM1 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGAP3Q96FM1 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGAP3Q96FM1 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGAP3Q96FM1 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGAP3Q96FM1 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGAP3Q96FM1 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGAP3Q96FM1 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGAP3Q96FM1 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGAP3Q96FM1 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGAP3Q96FM1 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGAP3Q96FM1 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGAP3Q96FM1 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGAP3Q96FM1 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAP3Q96FM1 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAP3Q96FM1 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAP3Q96FM1 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAP3Q96FM1 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAP3Q96FM1 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAP3Q96FM1 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAP3Q96FM1 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAP3Q96FM1 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAP3Q96FM1 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAP3Q96FM1 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAP3Q96FM1 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAP3Q96FM1 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAP3Q96FM1 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAP3Q96FM1 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAP3Q96FM1 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAP3Q96FM1 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAP3Q96FM1 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAP3Q96FM1 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAP3Q96FM1 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAP3Q96FM1 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAP3Q96FM1 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAP3Q96FM1 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAP3Q96FM1 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAP3Q96FM1 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAP3Q96FM1 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAP3Q96FM1 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAP3Q96FM1 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAP3Q96FM1 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAP3Q96FM1 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAP3Q96FM1 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAP3Q96FM1 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAP3Q96FM1 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAP3Q96FM1 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAP3Q96FM1 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAP3Q96FM1 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAP3Q96FM1 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAP3Q96FM1 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAP3Q96FM1 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAP3Q96FM1 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAP3Q96FM1 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAP3Q96FM1 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAP3Q96FM1 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAP3Q96FM1 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAP3Q96FM1 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAP3Q96FM1 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAP3Q96FM1 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAP3Q96FM1 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAP3Q96FM1 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAP3Q96FM1 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAP3Q96FM1 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAP3Q96FM1 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAP3Q96FM1 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAP3Q96FM1 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAP3Q96FM1 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAP3Q96FM1 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAP3Q96FM1 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAP3Q96FM1 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAP3Q96FM1 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAP3Q96FM1 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGAP3Q96FM1 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGAP3Q96FM1 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGAP3Q96FM1 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGAP3Q96FM1 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGAP3Q96FM1 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGAP3Q96FM1 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGAP3Q96FM1 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGAP3Q96FM1 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGAP3Q96FM1 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGAP3Q96FM1 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PGAP3Q96FM1 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGAP3Q96FM1 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PGAP3Q96FM1 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGAP3Q96FM1 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGAP3Q96FM1 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGAP3Q96FM1 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGAP3Q96FM1 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGAP3Q96FM1 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGAP3Q96FM1 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGAP3Q96FM1 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGAP3Q96FM1 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGAP3Q96FM1 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGAP3Q96FM1 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PGAP3Q96FM1 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.8 ms