Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIRT1Q96EB6 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms