Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms