Protein–RNA interactions for Protein: Q969S8

HDAC10, Histone deacetylase 10, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC10Q969S8 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms