Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms