Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113Q902F9 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms