Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TTC21AQ8NDW8 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.7 ms