Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS4

TMEM35B, Transmembrane protein 35B, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35BQ8NCS4 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.1 ms