Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM71DQ8N9W8 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms