Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWV2

CNTN4, Contactin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN4Q8IWV2 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CNTN4Q8IWV2 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CNTN4Q8IWV2 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CNTN4Q8IWV2 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CNTN4Q8IWV2 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CNTN4Q8IWV2 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CNTN4Q8IWV2 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CNTN4Q8IWV2 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTN4Q8IWV2 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTN4Q8IWV2 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTN4Q8IWV2 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTN4Q8IWV2 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTN4Q8IWV2 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTN4Q8IWV2 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTN4Q8IWV2 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTN4Q8IWV2 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTN4Q8IWV2 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTN4Q8IWV2 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTN4Q8IWV2 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTN4Q8IWV2 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTN4Q8IWV2 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTN4Q8IWV2 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTN4Q8IWV2 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTN4Q8IWV2 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTN4Q8IWV2 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTN4Q8IWV2 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CNTN4Q8IWV2 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTN4Q8IWV2 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTN4Q8IWV2 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTN4Q8IWV2 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTN4Q8IWV2 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTN4Q8IWV2 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTN4Q8IWV2 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTN4Q8IWV2 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CNTN4Q8IWV2 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CNTN4Q8IWV2 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTN4Q8IWV2 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTN4Q8IWV2 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CNTN4Q8IWV2 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTN4Q8IWV2 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTN4Q8IWV2 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CNTN4Q8IWV2 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNTN4Q8IWV2 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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CNTN4Q8IWV2 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNTN4Q8IWV2 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNTN4Q8IWV2 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNTN4Q8IWV2 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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CNTN4Q8IWV2 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNTN4Q8IWV2 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNTN4Q8IWV2 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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CNTN4Q8IWV2 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNTN4Q8IWV2 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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CNTN4Q8IWV2 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNTN4Q8IWV2 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNTN4Q8IWV2 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CNTN4Q8IWV2 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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CNTN4Q8IWV2 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNTN4Q8IWV2 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNTN4Q8IWV2 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CNTN4Q8IWV2 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNTN4Q8IWV2 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNTN4Q8IWV2 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNTN4Q8IWV2 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CNTN4Q8IWV2 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNTN4Q8IWV2 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNTN4Q8IWV2 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNTN4Q8IWV2 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNTN4Q8IWV2 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNTN4Q8IWV2 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNTN4Q8IWV2 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNTN4Q8IWV2 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNTN4Q8IWV2 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNTN4Q8IWV2 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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