Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms