Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7E8

UBE2Q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1Q7Z7E8 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBE2Q1Q7Z7E8 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms