Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

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Length 139 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 IL10-202ENST00000423557 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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LINC00299Q6ZSB3 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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LINC00299Q6ZSB3 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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LINC00299Q6ZSB3 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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LINC00299Q6ZSB3 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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LINC00299Q6ZSB3 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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LINC00299Q6ZSB3 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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LINC00299Q6ZSB3 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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