Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMBR1LQ6UX01 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMBR1LQ6UX01 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMBR1LQ6UX01 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMBR1LQ6UX01 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMBR1LQ6UX01 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMBR1LQ6UX01 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMBR1LQ6UX01 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMBR1LQ6UX01 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LMBR1LQ6UX01 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMBR1LQ6UX01 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMBR1LQ6UX01 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMBR1LQ6UX01 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LMBR1LQ6UX01 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LMBR1LQ6UX01 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMBR1LQ6UX01 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMBR1LQ6UX01 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMBR1LQ6UX01 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMBR1LQ6UX01 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMBR1LQ6UX01 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMBR1LQ6UX01 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMBR1LQ6UX01 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMBR1LQ6UX01 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMBR1LQ6UX01 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMBR1LQ6UX01 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMBR1LQ6UX01 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMBR1LQ6UX01 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LMBR1LQ6UX01 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMBR1LQ6UX01 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMBR1LQ6UX01 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LMBR1LQ6UX01 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LMBR1LQ6UX01 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMBR1LQ6UX01 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMBR1LQ6UX01 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMBR1LQ6UX01 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMBR1LQ6UX01 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMBR1LQ6UX01 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMBR1LQ6UX01 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMBR1LQ6UX01 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMBR1LQ6UX01 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMBR1LQ6UX01 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMBR1LQ6UX01 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMBR1LQ6UX01 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMBR1LQ6UX01 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMBR1LQ6UX01 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMBR1LQ6UX01 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMBR1LQ6UX01 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMBR1LQ6UX01 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMBR1LQ6UX01 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMBR1LQ6UX01 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMBR1LQ6UX01 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMBR1LQ6UX01 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMBR1LQ6UX01 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LMBR1LQ6UX01 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LMBR1LQ6UX01 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LMBR1LQ6UX01 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LMBR1LQ6UX01 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LMBR1LQ6UX01 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
LMBR1LQ6UX01 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LMBR1LQ6UX01 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LMBR1LQ6UX01 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LMBR1LQ6UX01 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
LMBR1LQ6UX01 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LMBR1LQ6UX01 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LMBR1LQ6UX01 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
LMBR1LQ6UX01 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LMBR1LQ6UX01 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LMBR1LQ6UX01 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LMBR1LQ6UX01 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms