Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC11.8□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 ALDH18A1-202ENST00000371224 3359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms