Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms