Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms