Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms