Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms