Protein–RNA interactions for Protein: Q16873

LTC4S, Leukotriene C4 synthase, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTC4SQ16873 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms