Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms