Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms