Protein–RNA interactions for Protein: Q16543

CDC37, Hsp90 co-chaperone Cdc37, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC37Q16543 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDC37Q16543 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDC37Q16543 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDC37Q16543 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDC37Q16543 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDC37Q16543 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDC37Q16543 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms