Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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GABRA6Q16445 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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GABRA6Q16445 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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GABRA6Q16445 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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