Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC17■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC17■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC17■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms