Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC14.65□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 184.7 ms