Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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