Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHPRHQ149N8 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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