Protein–RNA interactions for Protein: Q149M9

NWD1, NACHT domain- and WD repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NWD1Q149M9 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NWD1Q149M9 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NWD1Q149M9 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NWD1Q149M9 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NWD1Q149M9 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NWD1Q149M9 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NWD1Q149M9 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NWD1Q149M9 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NWD1Q149M9 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NWD1Q149M9 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NWD1Q149M9 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NWD1Q149M9 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NWD1Q149M9 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
NWD1Q149M9 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NWD1Q149M9 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NWD1Q149M9 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NWD1Q149M9 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NWD1Q149M9 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NWD1Q149M9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NWD1Q149M9 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NWD1Q149M9 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NWD1Q149M9 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NWD1Q149M9 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NWD1Q149M9 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NWD1Q149M9 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NWD1Q149M9 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NWD1Q149M9 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NWD1Q149M9 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NWD1Q149M9 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
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