Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 BCL2L12P1-201ENST00000508390 733 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
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CHD4Q14839 AL353997.6-201ENST00000583394 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
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CHD4Q14839 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
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CHD4Q14839 NDUFA3-214ENST00000485876 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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CHD4Q14839 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
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CHD4Q14839 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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CHD4Q14839 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
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CHD4Q14839 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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CHD4Q14839 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 AC110057.1-201ENST00000636031 898 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
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