Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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