Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA3AQ14563 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA3AQ14563 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA3AQ14563 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA3AQ14563 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA3AQ14563 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA3AQ14563 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA3AQ14563 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA3AQ14563 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA3AQ14563 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA3AQ14563 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA3AQ14563 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA3AQ14563 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA3AQ14563 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA3AQ14563 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA3AQ14563 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA3AQ14563 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA3AQ14563 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA3AQ14563 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA3AQ14563 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SEMA3AQ14563 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SEMA3AQ14563 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SEMA3AQ14563 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SEMA3AQ14563 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SEMA3AQ14563 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SEMA3AQ14563 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SEMA3AQ14563 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SEMA3AQ14563 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SEMA3AQ14563 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA3AQ14563 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA3AQ14563 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA3AQ14563 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA3AQ14563 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA3AQ14563 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA3AQ14563 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA3AQ14563 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA3AQ14563 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SEMA3AQ14563 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SEMA3AQ14563 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA3AQ14563 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA3AQ14563 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA3AQ14563 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SEMA3AQ14563 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA3AQ14563 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.05■□□□□ -0
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SEMA3AQ14563 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA3AQ14563 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
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SEMA3AQ14563 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA3AQ14563 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA3AQ14563 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SEMA3AQ14563 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA3AQ14563 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA3AQ14563 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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SEMA3AQ14563 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA3AQ14563 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SEMA3AQ14563 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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SEMA3AQ14563 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA3AQ14563 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA3AQ14563 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
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SEMA3AQ14563 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA3AQ14563 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA3AQ14563 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA3AQ14563 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA3AQ14563 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA3AQ14563 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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SEMA3AQ14563 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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SEMA3AQ14563 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
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SEMA3AQ14563 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA3AQ14563 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA3AQ14563 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA3AQ14563 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA3AQ14563 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA3AQ14563 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA3AQ14563 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA3AQ14563 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA3AQ14563 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA3AQ14563 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA3AQ14563 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA3AQ14563 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA3AQ14563 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA3AQ14563 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA3AQ14563 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SEMA3AQ14563 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA3AQ14563 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA3AQ14563 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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